1．划清罪与非罪的界限

 后果是否严重，是区分本罪与一般违法行为的重要标准。行为人严重不负责任，造成珍贵文物损毁或者流失，但其后果没有达到“严重”的程度，属于一般违法行为，不成立犯罪。《渎职侵权立案标准》在“一、渎职犯罪案件（三十五）失职造成珍贵文物损毁、流失案”中规定：涉嫌下列情形之一的，应予立案：(1)导致国家一、二、三级珍贵文物损毁或者流失的；(2)导致全国重点文物保护单位或者省、自治区、直辖市级文物保护单位损毁的；(3)其他后果严重的情形。在最高人民法院出台相关司法解释之前，审判窦践中把握本罪的罪与非罪的界限时，上述立案标准可以作为参考。

   2．划清本罪与过失损毁文物罪的界限

   两罪的主要区别有二：(1)前者的主体是特殊主体，后者的主体则为一般主体；(2)前者是一种职务犯罪，即国家机关工作人员，因严重不负责任，造成珍贵文物损毁或者流失的行为，后者不属于职务犯罪，且行为方式仅限于“损毁”。