1.划清罪与非罪的界限。拒绝提供间谍犯罪证据罪将拒绝提供的证据限于间谍犯罪证据。因此，如果拒绝提供间谍犯罪以外的其他犯罪的证据，无论是危害国家安全犯罪的证据，还是其他普通刑事犯罪的证据，都不构成犯罪。

   2．划清本罪与窝藏、包庇罪的界限。拒绝提供间谍犯罪证据的行为人可能是出于包庇的意图。在这种情况下，拒绝提供间谍犯罪证据的行为也是一种包庇行为。但是，这种包庇行为是一种不作为，而包庇罪的行为只限于积极的作为，不包括消极的不作为在内。