在实践中，植物新品种权权属、侵权纠纷主要有：

(1)植物新品种申请权权属纠纷，是指双方当事人因植物新品种的申请权归谁所有而引发的纠纷。

(2)植物新品种权权属纠纷，是指双方当事人就植物新品种权归谁所有而引发的纠纷。

(3)侵害植物新品种权纠纷，是指双方当事人因侵犯植物新品种权及其有关权益而引发的纠纷。