处理申请为失踪人财产指定、变更代管人案件的法律依据主要是《民法通则》第2章公民(自然人)中第3节宣告失踪和宣告死亡的相关规定，《民事诉讼法》第15章第3节宣告失踪、宣告死亡案件的相关规定，最高人民法院《关于贯彻执行(中华人民共和国民法通则)若干问题的意见(试行)》第30条、第34条、第35条以及最高人民法院《关于适用(1中华人民共和国民事诉讼法)若干问题的意见》的相关规定。