根据《最高人民法院关于适用＜中华人民共和国海事诉讼特别程序法）若干问题的解释》和《最高人民法院关于海事法院受理案件范围的若干规定》的规定，因船坞、码头建造合同纠纷提起的诉讼，由海事法院专门管辖。同时，根据《民事诉讼法》中有关地域管辖的规定，因船坞、码头建造合同纠纷提起的诉讼，由被告所在地或者合同履行地海事法院管辖。此外，根据《民事诉讼法》第34条的规定，在当事人协议管辖的情形下，应依据当事人的协议为依据确定管辖法院，即由原告住所地、被告住所地、合同签订地、  合同履行地或标的物所在地的海事法院管辖。

由于船坞、码头建造合同实际属于建设工程合同的一种，其具有建设工程合同的法律属性，在处理船坞、码头建造合同纠纷时也应当参照《合同法》中有关建设工程合同的规定。