仓储合同纠纷案件，按照合同纠纷案件的一般管辖原则，由被告住所地或合同履行地人民法院管辖。

在适用本案由时，要注意其与保管合同纠纷的区别。保管合同的保管人无特别资质要求，而仓储合同的保管人要求是仓库营业人。保管合同是诺成合同，仓储合同是实践合同。保管合同既有可能是有偿合同，也有可能是无偿合同，而仓储合同是有偿合同。此外，在保管物的验收及保管物的毁损、灭失的赔偿责任都有不同，适用时需注意毋将两者混淆。