破产抵销权纠纷系有关债务人财产的纠纷，依据《企业破产法》第21条的规定，应由受理破产申请案件的人民法院管辖。

破产抵销权纠纷属于破产派生诉讼，仅限于因行使破产抵销权而引发的纠纷，对于破产程序中因破产债权人与债务人互负种类相同且均已届清偿期的债务，债权人主张抵销的，应适用民法中关于抵销权的相关规定，而非属于本案由规定的纠纷。