在实践中，证券投资咨询纠纷主要有：

(1)证券投资咨询合同纠纷，是指当事人之间因证券投资咨询合同的成立、履行、终止等发生的纠纷。证券投资咨询合同时投资人或客户与证券投资咨询业务机构就证券、期货投资咨询服务签订的服务协议。

(2)证券投资咨询侵权纠纷，是指当事人在证券投资咨询活动过程中发生的损害赔偿责任的纠纷。