根据《刑事诉讼法》的规定，补充侦查有以下两种方式：

   (一)退回补充侦查

   退回补充侦查，是指决定补充侦查的人民检察院将案件退回公安机关进行补充侦查。根据《刑事诉讼法》的规定，退同补充侦查的案件必须是公安机关立案侦查的案件，人民检察院不能将自己直接受理的案件退给公安机关补充侦查。

人民检察院认为犯罪事实不清、证据不足或者遗漏罪行、遗漏同案犯罪嫌疑人等情形需要补充侦查的，应当提出具体的书面意见，连同案卷材料一并退回公安机关补充侦查。对人民检察院退回补充侦查的案件，公安机关根据不同情况，报县级以上公安机关负责人批准，分别作如下处理：

   (1)原认定犯罪事实清楚，证据不够充分的，应当在补充证据后，制作补充侦查报告书，移送人民检察院审查；对无法补充的证据，应当作出说明；

   (2)在补充侦查过程中，发现新的同案犯或者新的罪行，需要追究刑事责任的，应当重新制作起诉意见书，移送人民检察院审查；

   (3)发现原认定的犯罪事实有重大变化，不应当追究刑事责任的，应当重新提出处理意见，并将处理结果通知退查的人民检察院；

   (4)原认定犯罪事实清楚、证据确实充分，人民检察院退回补充侦查不当的，应当说明理由，移送人民检察院审查。

   (二)自行补充侦查

   自行补充侦查，是指决定补充侦查的人民检察院自行对案件进行的补充侦查。自行补充侦查的案件，既可以是原来由公安机关立案侦查的案件，也可以是人民检察院直接受理侦查的案件。如果是审查起诉阶段案件需要补充侦查，人民检察院既可以退回公安机关，由公安机关进行补充侦查，也可以由检察院自行侦查；如果是审判阶段案件需要补充侦查，只能由检察院自行补充侦查，而不能再退回公安机关，但必要时可以要求公安机关提供协助：

   在审查起诉阶段，人民检察院是退回补充侦查还是自行补充侦查，一般取决于未查明案件事实的内容和性质。如果主要事实不清、证据不足或者有遗漏罪行、遗漏同案犯罪嫌疑人等情形的，原则上应退回公安机关补充侦查；如果只是次要事实不清、证据不足的，则应尽可能自行补充侦查．以节省办案时间，提高诉讼效率。