注意划清本罪与非法获取国家秘密罪的界限。两者在侵犯的客体、主体、主观方面都有相同或者相似之处，其主要区别是：前者的犯罪对象仅限于属于国家绝密、机密的文件、资料或者其他物品，而后者的犯罪对象则包括任何一级的国家秘密；前者的行为方式是非法持有且拒不说明来源与用途；后者的行为方式则是以窃取、刺探、收买的方法非法获取。如果行为人以窃取、刺探、收买的方法非法获取属于国家绝密、机密的文件、资料或者其他物品后，又非法持有且拒不说明来源与用途的，应以非法获取国家秘密罪一罪处理。