在实践中，知识产权质押合同纠纷主要有：

(1）商标专用权质押合同纠纷，是指商标注册人以出质人身份将自己所拥有并依法可以转让的商标专用权作为债权的担保用权而与债权人订立的质押合同所引发的纠纷。

(2）专利权质押合同纠纷，是指专利权所有人以出质人身份将自己所拥有并依法可以转让的商标专用权作为债权的担保用权而与债权人订立的质押合同所引发的纠纷。

(3)著作权质押合同纠纷，是指债务人或者第三人依法将其著作权中的财产权出质，将该财产权作为债权的担保用权而与债权人订立的质押合同所引发的纠纷。