1．划清罪与非罪的界限

非法种植罂粟不满500株或者其他少量毒品原植物的，属违法行为，应当根据治安管理处罚法第71条第(1)项的规定，由公安机关给予治安处罚，即处10日以上15日以下拘留，可以并处3000元以下罚款；情节较轻的，处5日以下拘留或者500元以下罚款。按照《立案追诉标准（三）》第7条的规定，非法种植罂粟、大麻等毒品原植物，涉嫌下列情形之一的，应予立案追诉：(1)非法种植罂粟500株以上的；(2)非法种植大麻5000株以上的；(3)非法种植其他毒品原植物数量较大的；(4)非法种植罂粟200平方米以上、大麻2000平方米以上或者其他毒品原植物面积较大，尚未出苗的；(5)经公安机关处理后又种植的；(6)抗拒铲除的。

   2．划清本罪与制造毒品罪的界限

   前者是指种植毒品原植物的行为；后者则是指将毒品原植物进行加工、提炼、配制，使之成为可使用的毒品的行为。

   3．划清一罪与数罪的界限

   非法种植毒品原植物数量较大，又实施其他制造毒品行为的，应当分别以非法种植毒品原植物罪和制造毒品罪，实行并罚。