占有排除妨害纠纷一般应由占有物所在地的人民法院管辖。

在适用本案由时，要注意其与物权保护中排除妨害纠纷的区别。排除妨害纠纷是指因物权的行使受到他人的妨害而引发的以排除这种妨害为目的的纠纷。而占有排除妨害纠纷是指占有人请求排除他人妨害对其标的物占有的行为或事实状态而引起的纠纷。

占有排除妨害纠纷适用是以占有人和妨害占有人之间不存在其他法律关系为前提的；如果占有人与妨害占有人之间存在合同关系或者其他关系的，则应当适用其他案由而不适用本案由。