在实践中，确认不侵害知识产权纠纷主要有：

（1）确认不侵害专利权纠纷，是指专利权人作为被告，涉嫌侵权人作为原告主动提起诉讼，请求法院确认其行为不构成对被告专利权的侵犯。

（2）确认不侵害商标权纠纷，是指商标权人作为被告，涉嫌侵权人作为原告主动提起诉讼，请求法院确认其行为不构成对被告商标权的侵犯。

（3）确认不侵害著作权纠纷，是指著作权人或者邻接权人作为被告，涉嫌侵权人作为原告主动提起诉讼，请求法院确认其行为不构成对被告著作权或邻接权的侵犯。