企业兼并纠纷，是指一个企业在通过划转、购买、控股等形式取得其他企业产权的过程中，因使其他企业失去法人资格或改变法人实体而发生的纠纷。
在实践中，企业兼并大多发生在企业之间，通常是效益较好的企业兼并效益较差的企业，这种兼并，有政府主导式和企业主导式，政府主导式的企业兼并有时存在着“拉郎配”现象，由此往往产生企业兼并纠纷；而企业主导式或市场主导式的企业兼并，也有可能因为被兼并企业的债权、债务、职工安置和土地、房屋等资产的价格问题发生纠纷。
根据《民事诉讼法》的规定，因企业兼并合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。
应当注意区分企业合并与企业兼并这两个易混淆的概念。如前文所述，企业兼并是企业合并的上位概念，企业合并是企业兼并中企业结合最牢固的形式。以收购形式实现对企业控股的属于企业兼井，不同于企业合并，两者主要区别在于：(1)企业控股是企业收购形式，属于企业股东行为；企业合并是企业行为，但需经股东大会决议同意。(2)企业控股不发生被控股企业主体资格的消灭，企业合并导致被吸收企业或者合并各方（新设合并）主体资格消灭。(3)企业控股的法律后果仅为被控股企业股权发生变动，该企业资产和负债不发生转移；企业合井的法律后果是参与合并的企业可不经清算而消灭，消灭的企业资产和负债概括性地转移至存续企业或新设企业。
《最高人民法院关于审理与企业改制相关的民事纠纷案件若干问题的规定》（法释〔2003 ) 1号2003年2月1日起施行）
第三十条 企业兼井协议自当事人签字盖章之日起生效需经政府主管部门批准的，兼并协议自批准之日起生效；未经批准的，企业兼并协议不生效，但当事人在一审法庭辩论终结前补办报批手续的，人民法院应当确认该兼并协议有效。
第三十一条 企业吸收合井后，被兼并企业的债务应当由兼片方承担。
第三十二条 企业进行吸收合井时，参照公司法的有关规定，公告通知了债权人。企业吸收合并后，债权人就被兼并企业原资产管理人（出资人）隐瞒或者遗漏的企业债务起诉兼并方的，如债权人在公告期内中报过该笔债权，兼井方在承担民事责任后，可再行向被兼并企业原资产管理人（出资人）追偿。如债权人在公告期内未中报过该笔债权，则兼并方不承担民事责任。人民法院可告知债权人另行起诉被兼井企业原资产管理人（出资人）。
第三十三条 企业新设合并后，被兼并企业的债务由新设合并后的企业法人承担。
第三十四条 企业吸收合厂或新设合并后，被兼并企业应当办理而未办理工商注销登记，债权人起诉被兼并企业的，人民法院应当根据企业兼并后的具体情况，告知债权人追加责任主体，并判令责任主体承担民事责任。
第三十五条 以收购方式实现对企业控股的，被控股企业的债务，仍由其自行承担。但因控股企业抽逃资金、逃避债务，致被控股企业无力偿还债务的，被控股企业的债务则由控股企业承担。
《全民所有制工业企业转换经营机制条例》（国务院令第103号1992年7月23日起施行）
第十六条 企业享有联营、兼并权。
企业有权按照下列方式与其他企业、事业单位联营：
（一）与其他企业、事业一单位组成新的经济实体。独立承担民事责任、具备法人条件的，经政府有关部门核准登记，取得法人资格；
（二）与其他企业、事业单位共同经营，联营各方按照出资比例或者协议的约定，承担民事责任。
（三）与其他企业、事业单位订立联营合同，确立各方的权利和义务。联营各方各自独立经营、各自承担民事责任。
企业按照自愿、有偿的原则，可以兼并其他企业，报政府主管部门备案。
《关于企业兼并的暂行办法》（(1989〕体改经38号 1989年2月19日起施行）
四、企业兼并的形式
企业兼并主要有以下几种形式：
（一）承担债务式，即在资产与债务等价的情况下，兼并方以承担被兼并方债务为条件作为其资产。
（二）购买式，即兼并方出资购买被兼并方企业的资产。
（三）吸收股份式，即被兼并企业的所有者将被兼并企业的净资产作为股金投入兼并方，成为兼并方企业的一个股东。
（四）控股式，即一个企业通过购买其他企业的股权，达到控股，实现兼并。
企业兼并合同纠纷系企业在兼并其他企业过程中产生的合同纠纷，依据我国《民事诉讼法》第23条的规定，该类纠纷案件由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。
在适用本案由时，要注意区分企业合并与企业兼并这两个易混淆的概念。企业兼并是企业合并的上位概念，企业合并是企业兼并的一种形式。以收购形式实现对企业控股的属于企业兼并，不同于企业合并，两者主要区别在于：(1)企业控股是企业收购形式，属于企业股东行为；企业合并是企业行为，但需经股东大会决议同意。(2）企业控股不发生被控股企业主体资格的消灭，企业合并导致被吸收企业或者合并各方（新设合并）主体资格消灭。(3）企业控股的法律后果仅为被控股企业股权发生变动，该企业资产和负债不发生转移；企业合井的法律后果是参与合并的企业可不经清算而消灭，消灭的企业资产和负债概括性地转移至存续企业或新设企业。
